Die Umkehrosmose wird typischerweise zur Entsalzung von Wasser verwendet, da diese Filtrationsmethode das breiteste Anwendungsgebiet abdeckt, wie das Diagramm zeigt. Die Nanofiltration wird dagegen angewendet, um unerwünschte Komponenten ganz oder teilweise zu reduzieren.
Im Gegensatz zur Umkehrosmose arbeitet die Nanofiltration bei einem niedrigeren Druck, typischerweise unter 7 bar, was zu einem geringeren Energieverbrauch im Vergleich zu einer Umkehrosmoseanlage mit derselben Produktivität führt.